Das Welsgenom wird analysiert – für eine fischgerechte regionale Aquakultur
Genomanalyse für die Zucht des Afrikanischen Welses (Clarias gariepinus) in der Aquakultur Mecklenburg-Vorpommerns
Für die Zucht des Afrikanischen Welses ist es nützlich das Genom zu kennen, um praxisrelevante genetische Fragestellungen ableiten zu können, die zu einer verbesserten Vererbung gewünschter Merkmale beitragen. Neben typischen Produktionsmerkmalen, wie z.B. Wachstumsrate oder Futterquotient, gibt es aus der Praxis zum Fressverhalten der Welse in homogenen Gruppen zahlreiche Fragen zu bestimmten Phänomenen, deren mögliche genetische Ursachen noch unbekannt sind, die aber eine hohe wirtschaftliche Relevanz haben. Ohne Kenntnis des vollständigen Welsgenoms, können derartige Fragen nicht beantwortet werden.
Deshalb soll mit dem Projekt über eine unabhängige und vollständige Genomanalyse des Afrikanischen Welses die Datenlage zum Welsgenom für zukünftige Forschungsansätze radikal verbessert werden.
Für Praxisbetriebe ist die Genomanalyse eine wesentliche Grundvoraussetzung für nachhaltige züchterische Ansätze, welche über genetisch zufällige und rein phänotypbasierte Familienbildung hinausgeht.
Projektleitung
Forschungsinstitut für Nutztierbiologie Dummerstorf
Institut für Genombiologie
Abteilung Fischgenetik
Projektbearbeiter
Projektkoordinator:
Prof. Dr. habil. Tom Goldammer
Projektmitarbeiter:
Dr. Ronald M. Brunner (Institut für Genombiologie, FBN, Dummerstorf)
Dr. Alexander Rebl (Institut für Genombiologie, FBN, Dummerstorf)
Julien A. Nguinkal (Institut für Genombiologie, FBN, Dummerstorf)
Laufzeit
Februar 2021 bis Juni 2022
Finanzierung
Das Projekt wird gefördert aus Mitteln des Europäischen Meeres- und Fischereifonds (EMFF)
und des Landes Mecklenburg-Vorpommern.
Publikationen und Veranstaltungsbeiträge
FBN (2022) in NCBI, Genomsequenzdaten:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_024256425.1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample/SAMN27021044/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA818990/
Preprint der eingereichten Publikation:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.23.533919v1
Julien A. Nguinkal, Yedomon A. B. Zoclanclounon, Ronald M. Brunner , and Tom Goldammer
Haplotype-resolved telomere-to-telomere assembly of the African catfish (Clarias gariepinus) provides insights for semi-terrestrial adaptation of airbreathing catfishes
Abteilung Fischgenetik